- 平成28年度 秋季リーグ戦
| 1部 | 2部 | 3部 | 4部 | 5部 | 6部 | |
| 1位 | 中央大学 | 法政大学・Ⅱ | 日本体育大学 | 東京農業大学 | 千葉経済大学 | 健康科学大学 |
| 2位 | 国士舘大学 | 筑波大学 | 駒澤大学 | 明治薬科大学 | 千葉商科大学 | 東京薬科大学 |
| 3位 | 日本大学 | 亜細亜大学 | 千葉大学 | 一橋大学 | 東京農工大学 | 東京電機大学 |
| 4位 | 東海大学 | 青山学院大学 | 城西大学 | 首都大学東京 | 学習院大学 | 電気通信大学 |
| 5位 | 東洋大学 | 國學院大學 | 獨協大学 | 成蹊大学 | 東京理科大学 | 日本獣医生命科学大学 |
| 6位 | 専修大学 | 帝京大学 | 上智大学 | 立正大学 | 東京工業大学 | ─ |
- 平成28年度 秋季リーグ戦
| 1部 | 2部 | 3部 | 4部 | 5部 | 6部 | |
| 最優秀 選手賞 |
上野 太一 | 河原 優 | 佐藤 孝太 | 小林 大樹 | 根本 和輝 | 秋山 瑞貴 |
| (中央大４年) | (法政大Ⅱ３年) | (日体大３年) | (東京農大３年) | (千葉経大２年) | (健康科大３年) | |
| 最優秀 投手賞 |
木下 愛 | 藤本 将志 | 渡邊 一輝 | 粟津原 卓也 | 佐藤 充祥 | 栗原 暢大 |
| (中央大３年) | (法政大Ⅱ３年) | (日体大３年) | (明治薬大２年) | (千葉商大１年) | (東京電大２年) | |
| ５勝２敗 | ４勝１敗 | ５勝１敗 | ３勝０敗 | ３勝０敗 | ２勝０敗 | |
| 首位打者賞 | 高野 大地 | 齊藤 祥太郎 | 清水 拓朗 | 赤沼 峻行 | 馬場 裕真 | 廣井 一斗 |
| (日本大３年) | (帝京大４年) | (日体大２年) | (東京農大３年) | (千葉商大１年) | (東京薬大４年) | |
| ．４２５ | ．５００ | ．４３２ | ．５５０ | ．６１５ | ．６６７ | |
| 特別賞 | ─ | ─ | 山下 翔 | ─ | ─ | ─ |
| (駒澤大２年) | ||||||
| ノーヒットノーラン | ||||||
| 達成 |
- 平成28年度 秋季リーグ戦 （１部）
| 氏名 | 学校・学年 | 勝敗 | ||||
| 投手 | 木下 愛 | 中央大３年 | ５勝２敗 | |||
| 打率 | 打点 | 失策 | ポイント | |||
| 捕手 | 田中 宏樹 | 中央大４年 | ．４１５ | ８ | １ | ４９ |
| 一塁手 | 安良岡 将太 | 日本大３年 | ．３２７ | ９ | ２ | ４０ |
| 二塁手 | 湯浅 佳希 | 国士舘大３年 | ．３３３ | ４ | ４ | ３３ |
| 三塁手 | 緑川 皐太朗 | 中央大４年 | ．３２４ | ８ | ３ | ３７ |
| 遊撃手 | 上野 太一 | 中央大４年 | ．３４９ | １３ | ６ | ４２ |
| 外野手 | 高野 大地 | 日本大３年 | ．４２５ | １０ | ０ | ５３ |
| 外野手 | 土居 一磨 | 国士舘大３年 | ．４１８ | １２ | １ | ５３ |
| 外野手 | 眼龍 達矢 | 中央大２年 | ．４００ | ６ | ０ | ４６ |
| 指名打者 | 該当者なし | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
連盟特別表彰
鶴田 圭祐 帝京大学４年
（２０１６年プロ野球ドラフト会議で、東北楽天イーグルスより６位指名を受け、準硬式野球並びに東都大学連盟のアピールに貢献したことによる表彰）
